Од почетокот на пандемијата, дијагностичкото тестирање одигра витална улога во контролирањето на ширењето на САРС-КоВ-2, вирусот што предизвикуваCOVID-19.Брзи антигенски тестовиизведени дома или во клинички услови даваат резултати за 15 минути или помалку.Колку порано на лицето му се дијагностицира, толку побрзо може да побара лекарска помош и да се изолира од другите.Но, кога ќе се појават нови варијанти на вирусот, тие варијанти можеби нема да бидат откриени со овие тестови.
Повеќето брзи антигенски тестови се дизајнирани да го детектираат нуклеокапсидниот протеин SARS-CoV-2 или N-протеинот.Овој протеин се наоѓа во изобилство во вирусните честички и заразените луѓе.Комплет за брз тестs обично содржат две различни дијагностички антитела кои се врзуваат за различни делови од N протеинот.Кога антителото се врзува за N протеинот во примерокот, на комплетот за тестирање се појавува обоена линија или друг сигнал, што укажува на инфекција.
Протеинот N се состои од 419 структурни единици на аминокиселини.Било кој од нив може да се замени со друга аминокиселина со мутација.Истражувачка група предводена од д-р.Филип Френк и Ерик Ортлунд од Универзитетот Емори тргнаа да истражат како оваа единствена промена на аминокиселината влијае на изведбата на брзиот тест за антиген.Тие користеа техника наречена длабоко скенирање на мутации за истовремено да проценат како секоја мутација на протеинот N на вирусот влијае врз врзувањето за дијагностичко антитело.Нивните резултати беа објавени во Cell на 15 септември 2022 година.
Истражувачите создадоа сеопфатна библиотека од речиси 8.000 мутации на протеин N.Овие варијанти сочинуваат повеќе од 99,5% од сите можни мутации.Тие потоа процениле како секоја варијанта има интеракција со 17 различни дијагностички антитела користени во 11 комерцијално достапни брзи антигенски тестови, вклучително и заедничкидомашни комплети.
Тимот процени кои мутации на N-протеинот влијаат на препознавањето на антителата.Врз основа на овие информации, тие создадоа „профил на мутација за бегство“ за секое дијагностичко антитело.Овој профил идентификува специфични мутации во протеинот N кои можат да влијаат на способноста на антителото да се врзе за својата цел.Анализата покажа дека антителата што се користат во денешните брзи тестови ги препознаваат и ги врзуваат сите минати и сегашни варијанти на САРС-КоВ-2 што предизвикуваат загриженост и загриженост.
Иако неколку дијагностички антитела го препознаваат истиот регион на N протеинот, истражувачите откриле дека секое антитело има уникатен потпис на мутации за бегство.Бидејќи вирусот САРС-КоВ-2 продолжува да мутира и да генерира нови варијанти, овие податоци може да се користат за означување на антителата на комплетот за тестирање кои можеби ќе треба повторно да се проценат.
„Точната и ефикасна идентификација на заразените индивидуи останува критична стратегија за ублажување на СОВИД-19, а нашата студија дава информации за идните мутации на САРС-КоВ-2 што би можеле да се мешаат во откривањето“, рече Ортлунд.„Резултатите наведени овде ни овозможуваат брзо да се прилагодиме на овој вирус бидејќи продолжуваат да се појавуваат нови варијанти, кои претставуваат непосредни клинички и јавно здравствени импликации“.
Позадина: Длабокото скенирање на мутација открива мутации за бегство во нуклеокапсидот SARS-CoV-2 со помош на моментално достапни брзи антигенски тестови.Френк Ф., Кин М.М., Рао А., Басит Л., Лиу Х, Бауерс ХБ, Пател АБ, Като МЛ, Саливан ЈА, Гринлиф М., Пјантадоси А., Лам ВА, Хадсон В.Х., Ортлунд ЕА ќелија.2022 септември 15; 185 (19): 3603-3616.е13.МВР: 10.1016/j.cell.2022.08.010.29 август 2022 година PMID: 36084631.
Финансирање: Национален институт за биомедицински слики и биоинженеринг NIH (NIBIB), Национален институт за дијабетес, дигестивни и бубрежни заболувања (NIDDK) и Национален институт за алергија и заразни болести (NIAID), Американско здружение за срце.
NIH Research Matters е неделно ажурирање на клучните наоди од истражувањето на NIH прегледани од експерти на NIH.Истиот е објавен од Канцеларијата за комуникации и односи со јавноста на директорот на Националниот институт за здравство.